新制度經(jīng)濟(jì)學(xué)這一定義更開(kāi)始由威廉姆森在二十世紀(jì)七十年代宣布提，但新制度經(jīng)濟(jì)學(xué)公司基礎(chǔ)理論的發(fā)源應(yīng)當(dāng)上溯1937年科斯( RonaldCoase)《企業(yè)的性質(zhì)》一文的發(fā)布，后經(jīng)威廉姆森等諸多經(jīng)濟(jì)師的不斷完善與發(fā)展趨勢(shì)，慢慢獲得健全。
新制度經(jīng)濟(jì)學(xué)有關(guān)公司基礎(chǔ)理論的闡述能夠根據(jù)三個(gè)關(guān)鍵的基礎(chǔ)理論支系開(kāi)展表明：1．交易手續(xù)費(fèi)社會(huì)經(jīng)濟(jì)學(xué)。2．產(chǎn)權(quán)理論。3．授權(quán)委托——代理理論(Principal-agent Theory)。
綜上所述，新制度經(jīng)濟(jì)學(xué)公司基礎(chǔ)理論較新古典經(jīng)濟(jì)學(xué)公司基礎(chǔ)理論的發(fā)展之處取決于：①擺脫了新古典經(jīng)濟(jì)學(xué)公司基礎(chǔ)理論中公司做為明確外生變量的假定基本，從交易手續(xù)費(fèi)的視角創(chuàng)造性表述了企業(yè)的本質(zhì)；②更改了新古社會(huì)經(jīng)濟(jì)學(xué)公司基礎(chǔ)理論非契約書的統(tǒng)計(jì)分析方法，把我們?cè)谄綍r(shí)文化生活中了解的規(guī)章制度、自然環(huán)境等要素列入剖析架構(gòu)中，使原來(lái)實(shí)體模型更為接近實(shí)際；③改正了新古典經(jīng)濟(jì)學(xué)公司基礎(chǔ)理論的“黑箱子”，剛開(kāi)始重視企業(yè)內(nèi)部組織關(guān)系的剖析，公司基礎(chǔ)理論的科學(xué)研究范疇獲得進(jìn)一步擴(kuò)展；④明確提出了更接近實(shí)際的基礎(chǔ)理論假定，如有限理性、機(jī)會(huì)主義和效應(yīng)利潤(rùn)更大化等。